В период с 28 ноября по 02 декабря 2016 года проведена государственная аттестация КГУ «Лисаковская специальная школа-интернат для детей с особыми образовательными потребностями» Управления образования акимата Костанайской области.

Согласно приказу Департамента по контролю в сфере образования Костанайской области от 05 декабря 2016 года №533 образовательная деятельность КГУ «Лисаковская специальная школа-интернат для детей с особыми образовательными потребностями» Управления образования акимата Костанайской области соответствует требованиям государственного общеобязательного стандарта начального образования, не соответствует требованиям государственного общеобязательного стандарта среднего образования (начального, основного среднего, общего среднего образования).